Klinicky izolovaný syndrom (CIS) se popisuje první příznaky (neurologické obtíže), které by mohly být ukazatelem, že se jedná o začínající roztroušenou sklerózu. Dá se tedy říci, že se jedná o první ataku RS. Nejčastěji se projeví jako zánět opticu, tinitus, nebo slabost končetin či bolesti v oblasti trigeminu. Projev jsou dle zasaženého systému různé.